根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》規(guī)定，企業(yè)必須要提供前三年的年度審計報告，以及高新產(chǎn)品產(chǎn)值專項審計報告和研發(fā)經(jīng)費的專項審計報告，一共五份審計報告。 而匯算清繳報告雖然也是會計師事務(wù)所出具，但是并不具備審計報告的特性，不能作為審計報告來用。匯算清繳報告不能等同于審計報告。

年度審計報告可以補辦，這個問題不大，而高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申報專項審計報告兩份的話，需要找科技廳核定具備資格的會計師事務(wù)所來做方可以。建議到當(dāng)?shù)乜萍紡d的網(wǎng)站，下載經(jīng)過審查的認(rèn)定有資格的會計師事務(wù)所名稱，分別聯(lián)系溝通，確定哪家做即可以。