所謂“三表一致”是指，《企業(yè)所得稅納稅申報表》期間費用明細表中列示的研發(fā)費用、企業(yè)財務(wù)審計報告中列示的研發(fā)費用、專項審計報告中列示的研發(fā)費用數(shù)據(jù)要求一致。

（一）“三表不一致”出現(xiàn)的原因

1、歸集口徑不一致

由于高新技術(shù)企業(yè)認定對研發(fā)費用的歸集口徑與加計扣除對研發(fā)費用的歸集口徑不一致，后者嚴于前者。企業(yè)的通常做法，對研發(fā)費用日常賬目核算歸集，采用高新歸集口徑，申報加計扣除時，由于加計統(tǒng)計口徑更為嚴格（例如，），則導(dǎo)致可加計的費用額＜賬目上顯示的研發(fā)費用總額。稅務(wù)師事務(wù)所在進行審計時，則可能按照趨嚴的標準，對企業(yè)的研發(fā)費用進行調(diào)整。

2、研發(fā)人員任職時間不得低于183天的要求

《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》規(guī)定，科技人員是指累計實際工作時間在183天以上的人員。由于部分行業(yè)企業(yè)流動性大，企業(yè)無法在立項之初，研發(fā)費用核算之初就預(yù)知科技人員是否能夠最終滿足183天的工作要求，僅能按照研發(fā)工作實際將研發(fā)人員費用歸集入相應(yīng)的研發(fā)項目。但稅務(wù)師事務(wù)所進行研發(fā)費用專項審計時，包括企業(yè)進行研發(fā)費用加計扣除時會將不滿足工作時間要求的人員剔除，由此導(dǎo)致報告數(shù)據(jù)與賬目列示數(shù)據(jù)不一致。